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- 1.杀菌：
全光喷雾扦插育苗过程中一般真菌为害较少。因为在喷雾条件下真菌的孢子不易在水中萌发。但在湿热条件下细菌容易增殖，特别是嫩枝扦插，插穗组织幼嫩，插穗剪制过程造成的伤口较多，容易感染细菌，若不加控制会迅速蔓延。因此，在插前对插穗进行杀菌处理十分重要，尤其对生根较难的树种更为重要。
插穗杀菌处理一般可采用有机汞剂、波尔多液、多菌灵、托布津和百菌清等。处理方法有插穗浸泡和基部浸泡两种。以基部浸泡为主，因细菌感染以基部为主，还能避免造成叶片产生药害。一般用1000倍液的上述药剂浸泡15～30分钟，波尔多液多采用等量式（1千克水：400克硫酸铜：400克生石灰）处理。有时杀菌剂处理和生长素处理同时进行。
2.生长激素处理：
生长激素处理可有效地提高扦插生根率，缩短生根时间和增加发根数量。常用的生长激素主要有萘乙酸和吲哚丁酸两种。其中吲哚丁酸作用明显，又不易产生药害，应用较多，但价格较贵。对于生根较容易的树种用萘乙酸处理即可。处理方法有三种：
（1）低浓度浸泡方法：先将吲哚丁酸或萘乙酸溶解在少量的50%酒精中，再加水稀释至一定浓度。嫩枝扦插一般处理浓度为10～100毫克/千克，浸泡12～24小时。低浓度浸泡效果比较稳定，效果较好，但比较费事，大规模扦插难于采用。
（2）高浓度速蘸处理：将吲哚丁酸或萘乙酸先溶解在少量50%酒精中，再用50%酒精稀释到一定浓度（500～2000毫克/千克），将插穗基部2厘米左右在溶液中速蘸1～5秒取出扦插。此法简单，处理迅速，但处理效果不如低浓度浸泡法稳定。
（3）粉剂处理：将吲哚丁酸或萘乙酸先溶解在少量无水酒精后混入少量滑石粉，置荫凉处待酒精蒸发后，将滑石粉研碎再混入一定量的滑石粉中，一般使用浓度为1000～8000毫克/千克，将插穗下部插入粉剂中深1～2厘米，使湿润的下切口粘上一层粉剂，然后扦插。粉剂处理方便，且省时间，适于大规模扦插，但处理效果不如低浓度浸泡稳定。
此外，还可用蔗糖、维生素类、高锰酸钾、硼酸等处理插穗，或与生长激素混合使用，但这些物质的处理效果，一般没有植物生长激素处理的明显，不常用。